第08版:科教卫生 上一版   
上一篇 下一篇

云南农大科研团队发布茶叶多组学综合数据库

本报讯(记者 陈怡希 实习生 崔语珊) 近日,云南农业大学盛军教授团队发表最新研究成果。该研究搜集并整合了山茶属多个参考基因组、重测序、转录组等组学数据,提供了3项独立研究,包括泛基因组、临沧茶树重测序与土壤宏基因组测序数据以及多种在线分析工具,构建了综合性的山茶属多组学数据库(Teabase),为山茶属遗传育种提供重要的数据支撑和检索分析平台。

盛军教授研究团队长期致力于茶叶基因组、功效成分以及功能机理的研究,近期开发了世界上首个综合茶叶多组学数据库(Teabase),收录了大量茶叶相关的多组学数据,一半以上的数据为首次发表,包括12个参考基因组和一份泛基因组组装、100份转录组,705份全球茶叶种质资源的遗传信息、1350份云南临沧地区古树茶重测序及对应的448份宏基因组测序数据,上亿条变异数据,此外还有4份遗传图谱,3组共线性也包含在茶叶多组学数据库中。

该团队将这些数据整合为8个基础模块,其中种和种质页面基于闵天禄茶属分类系统搭建数据库框架,共收集了265个种以及714个品种的分类信息,满足普通用户对山茶属生物资源信息的了解。数据库中采用了大量的交互式可视化图表,满足研究学者对基因、变异位点、基因表达等信息的检索、分析、整合以及下载等需求。此外,团队还开发了一系列实用分析工具,如引物设计、基因组浏览器、基因表达查看等,共同构成了茶叶多组学数据库的核心功能。

  • 汇聚创新资源 助力企业成长

  • 体育赛事丰富学生暑期生活

  • 报头

  • 云南农大科研团队发布茶叶多组学综合数据库

  • 省农科院经作所红花研究创佳绩

  • 全国大学生化工设计竞赛西南赛区总决赛举办

  • 省一院成立头痛中心

  • 省一院成功救治一名“恐龙血”患者

  • 省肿瘤医院开展头颈肿瘤义诊活动

  • 云南这朵“菌儿”社会实践活动启动

  • 报脚

  • 滇ICP备08000875号 互联网新闻信息服务许可证编号:53120170002 信息网络传播视听节目许可证号:2511600
    互联网出版许可证:新出网证(滇)字 04号
    广播电视节目制作经营许可证号:(云)字第00093号
    电信增值业务经营许可证编号:滇B2-20090008 ® yunnan.cn All Rights Reserved since 2003.08
    未经云南网书面特别授权,请勿转载或建立镜像,违者依法必究