本报讯(记者 陈怡希 实习生 崔语珊) 近日,云南农业大学盛军教授团队发表最新研究成果。该研究搜集并整合了山茶属多个参考基因组、重测序、转录组等组学数据,提供了3项独立研究,包括泛基因组、临沧茶树重测序与土壤宏基因组测序数据以及多种在线分析工具,构建了综合性的山茶属多组学数据库(Teabase),为山茶属遗传育种提供重要的数据支撑和检索分析平台。
盛军教授研究团队长期致力于茶叶基因组、功效成分以及功能机理的研究,近期开发了世界上首个综合茶叶多组学数据库(Teabase),收录了大量茶叶相关的多组学数据,一半以上的数据为首次发表,包括12个参考基因组和一份泛基因组组装、100份转录组,705份全球茶叶种质资源的遗传信息、1350份云南临沧地区古树茶重测序及对应的448份宏基因组测序数据,上亿条变异数据,此外还有4份遗传图谱,3组共线性也包含在茶叶多组学数据库中。
该团队将这些数据整合为8个基础模块,其中种和种质页面基于闵天禄茶属分类系统搭建数据库框架,共收集了265个种以及714个品种的分类信息,满足普通用户对山茶属生物资源信息的了解。数据库中采用了大量的交互式可视化图表,满足研究学者对基因、变异位点、基因表达等信息的检索、分析、整合以及下载等需求。此外,团队还开发了一系列实用分析工具,如引物设计、基因组浏览器、基因表达查看等,共同构成了茶叶多组学数据库的核心功能。


